Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtn4Q99P72 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtn4Q99P72 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rtn4Q99P72 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rtn4Q99P72 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rtn4Q99P72 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtn4Q99P72 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rtn4Q99P72 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms