Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Atp1b4Q99ME6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atp1b4Q99ME6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atp1b4Q99ME6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms