Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtm3Q99LJ5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm3Q99LJ5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm3Q99LJ5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms