Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ophn1Q99J31 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ophn1Q99J31 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ophn1Q99J31 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms