Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABRG3Q99928 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRG3Q99928 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRG3Q99928 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms