Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD9AQ99638 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD9AQ99638 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD9AQ99638 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD9AQ99638 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms