Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNQ99608 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNQ99608 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNQ99608 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDNQ99608 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDNQ99608 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDNQ99608 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDNQ99608 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NDNQ99608 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDNQ99608 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDNQ99608 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDNQ99608 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDNQ99608 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDNQ99608 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDNQ99608 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDNQ99608 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDNQ99608 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDNQ99608 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDNQ99608 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDNQ99608 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDNQ99608 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NDNQ99608 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNQ99608 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNQ99608 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNQ99608 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNQ99608 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNQ99608 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNQ99608 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNQ99608 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNQ99608 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNQ99608 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDNQ99608 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDNQ99608 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDNQ99608 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDNQ99608 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDNQ99608 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDNQ99608 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDNQ99608 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDNQ99608 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDNQ99608 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDNQ99608 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NDNQ99608 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDNQ99608 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDNQ99608 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDNQ99608 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDNQ99608 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDNQ99608 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDNQ99608 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDNQ99608 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDNQ99608 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDNQ99608 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDNQ99608 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDNQ99608 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDNQ99608 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDNQ99608 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDNQ99608 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDNQ99608 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDNQ99608 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDNQ99608 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NDNQ99608 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDNQ99608 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDNQ99608 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNQ99608 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNQ99608 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNQ99608 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNQ99608 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNQ99608 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNQ99608 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNQ99608 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNQ99608 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNQ99608 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNQ99608 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNQ99608 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDNQ99608 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDNQ99608 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDNQ99608 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDNQ99608 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDNQ99608 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDNQ99608 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NDNQ99608 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDNQ99608 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDNQ99608 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDNQ99608 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDNQ99608 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDNQ99608 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDNQ99608 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NDNQ99608 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDNQ99608 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDNQ99608 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDNQ99608 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDNQ99608 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDNQ99608 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDNQ99608 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NDNQ99608 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDNQ99608 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDNQ99608 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNQ99608 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNQ99608 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNQ99608 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDNQ99608 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms