Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX18Q96RF0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX18Q96RF0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX18Q96RF0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms