Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC85AQ96PX6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC85AQ96PX6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC85AQ96PX6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC85AQ96PX6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms