Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RNPC3Q96LT9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNPC3Q96LT9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNPC3Q96LT9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms