Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ4

MSLNL, Mesothelin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNLQ96KJ4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MSLNLQ96KJ4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSLNLQ96KJ4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSLNLQ96KJ4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSLNLQ96KJ4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms