Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PRAC1Q96KF2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PRAC1Q96KF2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms