Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SERAC1Q96JX3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SERAC1Q96JX3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SERAC1Q96JX3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SERAC1Q96JX3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SERAC1Q96JX3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SERAC1Q96JX3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SERAC1Q96JX3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SERAC1Q96JX3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms