Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS50Q96JG6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VPS50Q96JG6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS50Q96JG6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms