Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN37Q96GY3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN37Q96GY3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN37Q96GY3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIN37Q96GY3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIN37Q96GY3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms