Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NMD3Q96D46 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMD3Q96D46 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms