Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NXPE3Q969Y0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NXPE3Q969Y0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NXPE3Q969Y0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms