Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TSR2Q969E8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
TSR2Q969E8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TSR2Q969E8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209 ms