Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prpf3Q922U1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf3Q922U1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf3Q922U1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms