Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Synpo2Q91YE8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Synpo2Q91YE8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Synpo2Q91YE8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Synpo2Q91YE8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Synpo2Q91YE8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Synpo2Q91YE8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Synpo2Q91YE8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Synpo2Q91YE8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Synpo2Q91YE8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Synpo2Q91YE8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Synpo2Q91YE8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Synpo2Q91YE8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms