Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chrna2Q91X60 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chrna2Q91X60 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chrna2Q91X60 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms