Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRSF12Q8WXF0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF12Q8WXF0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms