Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC13A3Q8WWT9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC13A3Q8WWT9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms