Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU66

TSPEAR, Thrombospondin-type laminin G domain and EAR repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPEARQ8WU66 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSPEARQ8WU66 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPEARQ8WU66 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPEARQ8WU66 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms