Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDD8

Washc1, WASH complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc1Q8VDD8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Washc1Q8VDD8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Washc1Q8VDD8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc1Q8VDD8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms