Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY3

ACTRT2, Actin-related protein T2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT2Q8TDY3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTRT2Q8TDY3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTRT2Q8TDY3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT2Q8TDY3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms