Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC45.76■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC45.76■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC45.75■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC45.75■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.75■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC45.74■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC45.71■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC45.71■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC45.64■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.64■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC45.64■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC45.61■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC45.57■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC45.57■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC45.57■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC45.56■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms