Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCOLN3Q8TDD5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN3Q8TDD5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN3Q8TDD5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms