Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk8Q8R3L8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdk8Q8R3L8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk8Q8R3L8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms