Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SETD9Q8NE22 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SETD9Q8NE22 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SETD9Q8NE22 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SETD9Q8NE22 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD9Q8NE22 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD9Q8NE22 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD9Q8NE22 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD9Q8NE22 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SETD9Q8NE22 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SETD9Q8NE22 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SETD9Q8NE22 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SETD9Q8NE22 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SETD9Q8NE22 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 913.1 ms