Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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CA13Q8N1Q1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CA13Q8N1Q1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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CA13Q8N1Q1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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CA13Q8N1Q1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CA13Q8N1Q1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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CA13Q8N1Q1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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CA13Q8N1Q1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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CA13Q8N1Q1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CA13Q8N1Q1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CA13Q8N1Q1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CA13Q8N1Q1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CA13Q8N1Q1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CA13Q8N1Q1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CA13Q8N1Q1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CA13Q8N1Q1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CA13Q8N1Q1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CA13Q8N1Q1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CA13Q8N1Q1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CA13Q8N1Q1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CA13Q8N1Q1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CA13Q8N1Q1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CA13Q8N1Q1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms