Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdk5rap2Q8K389 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdk5rap2Q8K389 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cdk5rap2Q8K389 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdk5rap2Q8K389 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms