Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rassf9Q8K342 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rassf9Q8K342 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rassf9Q8K342 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms