Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ssh3Q8K330 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ssh3Q8K330 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms