Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brd3Q8K2F0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd3Q8K2F0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd3Q8K2F0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms