Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sde2Q8K1J5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sde2Q8K1J5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sde2Q8K1J5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms