Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZI9

IFNL3, Interferon lambda-3, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL3Q8IZI9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFNL3Q8IZI9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNL3Q8IZI9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNL3Q8IZI9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms