Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARP9Q8IXQ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARP9Q8IXQ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms