Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp27Q8CEG8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp27Q8CEG8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp27Q8CEG8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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