Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Phf20l1Q8CCJ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Phf20l1Q8CCJ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Phf20l1Q8CCJ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms