Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp9Q8CAS9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp9Q8CAS9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp9Q8CAS9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp9Q8CAS9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Parp9Q8CAS9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp9Q8CAS9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp9Q8CAS9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp9Q8CAS9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp9Q8CAS9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp9Q8CAS9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp9Q8CAS9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp9Q8CAS9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp9Q8CAS9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp9Q8CAS9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Parp9Q8CAS9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Parp9Q8CAS9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp9Q8CAS9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms