Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Spef2Q8C9J3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Spef2Q8C9J3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Spef2Q8C9J3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Spef2Q8C9J3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212.4 ms