Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ppfibp1Q8C8U0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppfibp1Q8C8U0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppfibp1Q8C8U0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms