Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms