Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cwc22Q8C5N3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cwc22Q8C5N3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cwc22Q8C5N3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cwc22Q8C5N3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms