Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf428Q8C1M2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf428Q8C1M2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf428Q8C1M2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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