Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUE1

Slc9a4, Sodium/hydrogen exchanger 4, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a4Q8BUE1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a4Q8BUE1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a4Q8BUE1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a4Q8BUE1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a4Q8BUE1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a4Q8BUE1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms