Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Klhl38Q8BSF5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhl38Q8BSF5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl38Q8BSF5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms