Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Snapc4Q8BP86 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snapc4Q8BP86 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Snapc4Q8BP86 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Snapc4Q8BP86 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snapc4Q8BP86 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snapc4Q8BP86 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snapc4Q8BP86 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snapc4Q8BP86 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snapc4Q8BP86 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snapc4Q8BP86 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snapc4Q8BP86 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snapc4Q8BP86 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snapc4Q8BP86 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snapc4Q8BP86 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snapc4Q8BP86 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snapc4Q8BP86 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snapc4Q8BP86 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snapc4Q8BP86 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms