Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp1Q8BJQ2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp1Q8BJQ2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp1Q8BJQ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms